菌落總數試片中含有一種紅色指示染料，可使菌落呈現紅色便于計數，計算出所有紅色菌落，不論大小和顏色深淺。
3m試片菌落計數的適宜計數范圍為25~250。
試件的計數面積約為20cm2。每個黃色方框的面積是1cm2。當菌落總數超過250時，為了估計菌落數，可選擇一個或幾個有代表性的小方塊(1cm2)。計算平均菌落數，然后乘以20，得到試片上的菌落數。
當試片上的菌落數過多而無法計數時，記錄為“TNTC”。
菌落數量非常多，使整個生長區域呈粉紅色，或在生長邊緣區域只觀察到單個菌落，記為“TNTC”。
菌落數量多，有時菌落分布不均，記為“TNTC”。
可以看到直徑較大的菌落并進行計數，但仔細觀察會發現計數區域分布著非常密集和微小的菌落，記為“TNTC”。
少量菌株會將試片上的培養基液化，計數區出現粉紅色液化區。此時不要記錄液化區域的紅點，統計未液化區域的菌落數，選取幾個有代表性的正方形(1cm2)無液化部分。計算平均菌落數，乘以20。得到結果。
注意顆粒區和樣品殘渣區。有些樣品會含有一些紅色殘余顆粒。菌落應為紅色圓形，而顆粒形狀不規則。如果樣品以紅色顆粒為主(如辣椒粉)，則此類樣品的菌落總數不得用3M菌落總數試片檢測。
